Sýlíkon bakteríudrepandi efni ná aðallega bakteríudrepandi áhrifum á eftirfarandi hátt:
Losun bakteríudrepandi efna: Sýlíkon sýklalyf innihalda oft bakteríudrepandi virk efni eins og silfurjónir, koparjónir og sinkjónir, sem geta eyðilagt frumuveggi eða frumuhimnur örvera eins og baktería og sveppa, hindrað vöxt þeirra og æxlun.
Ljóshvatahvata: Sum kísill bakteríudrepandi efni nota ljóshvatatækni, svo sem nanótítantvíoxíð (TiO2), sem getur framleitt mjög oxandi sindurefna undir útfjólubláu ljósi og þar með drepið eða hindrað vöxt örvera.
Líkamleg hindrun: Kísillefnið sjálft hefur ákveðinn þéttleika og vatnsfælni, sem getur komið í veg fyrir að örverur festist og vaxi á yfirborði efnisins að vissu marki.